三级健康管理师考试科目为《基础知识》和《操作技术》两门，考试教材也相应的分为《健康管理师基础知识》和《健康管理师职业资格三级》两本。

三级健康管理师教材由人民卫生出版社统一发布；其中理论考试以常见慢性病知识、粤秀教育学、养分与食品安全、身体活动基本知识、健康稳妥与健康管理为考试重点，理论考试的内容中有掺和实践技术部分的知识，主要内容以实践技术部分第二章健康风险评估和剖析为主，两门科目的内容并不是独立的，而是彼此贯通的。